Magdalena Dębska, Jacek Drabik
Streszczenie
Celem przeprowadzonych badań było porównanie efektywności różnych metod izolacji kwasów nukleinowych w aspekcie ilościowym, jakościowym i ekonomicznym. Przetestowano dwa zestawy przeznaczone do izolacji DNA opierające się na separacji magnetycznej: NucleoMag 96 Trace i DNA IQTM System oraz dwa zestawy kolumienkowe z membraną silikonową: NucleoSpin® Tissue XS i QIAamp® DNA Micro. W artykule przedstawiono wyniki analizy testowanych zestawów do izolacji DNA. Badanym materiałem biologicznym była wysuszona krew na podłożu jałowym oraz na podłożu zawierającym inhibitor reakcji PCR, a także materiał zdegradowany. Po izolacji DNA z różnych objętości krwi na jałowym podłożu najbardziej wydajnymi pod względem jakościowym były metody organiczna oraz NucleoSpin® Tissue XS. W przypadku materiału zdegradowanego oraz przy ekstrakcji DNA z podłoża zawierającego inhibitor reakcji PCR najwięcej pełnych profili uzyskano przy zastosowaniu metody DNA IQTM System. Badania tą metodą wykonano w najkrótszym czasie. Najniższy koszt w przeliczeniu na jedną próbkę uzyskano dla zestawu NucleoMag 96 Trace.
Słowa klucze: metody izolacji DNA, Separacja magnetyczna, kulki paramagnetyczne, membrana silikonowa, ślady biologiczne, kryminalistyczne badania DNA.
Summary
The purp0se of the research was to compare the efficiency of different DNA extraction methods from arranged forensic samples. There were tested four commercial kits: two of them based magnetic separation: NucleoMag 96 Trace i DNA IQTM System and two of them based on silica membrane: NucleoSpin®Tissue XS and QIAamp® DNA Micro. In the article were presented results of extraction from dried blood spots on sterile linen as well as on jeans contained PCR inhibitor and also from degraded DNA. The best results in the quality aspect were obtained from dried blood spots on sterile linen using NucleoSpin® Tissue XS and organic method. DNA IQTM System was the most effective method in case of degraded DNA and samples contained PCR inhibitor. These method required also the shortest time to perform the whole procedure of extraction. The lowest overall cost per one sample were in NucleoMag 96 Trace.
Keywords: DNA extraction methods, magnetic separation, paramagnetic beads, silica membrane, forensic biology.