Analiza 10 loci STR zestawu SGM Plus w próbie populacji ludności Wielkopolski

Natalia Rogalska-Niżnik, Jolanta Różańska-Zawieja, Zbigniew Sobek

Streszczenie

W pracy przedstawiono wyniki badań częstości alleli 10 loci typu STR uzyskane dla próby populacyjnej ludności z terenu Wielkopolski. Wyizolowane metodą organiczną DNA z 214 próbek w postaci krwi i wymazów z jamy ustnej amplifikowano metodą PCR z użyciem zestawu odczynników AmpFISTR® SGM PlusTM firmy Applied Biosystems. Produkty amplifikacji poddano elektroforezie płytowej w żelu poliakrylamidowym z użyciem sekwenatora ABI PRISMO 377. Analizę otrzymanych wyników przeprowadzono z użyciem programu GeneScan® i Genotyper® 3.7 NT. Uzyskane dane poddano analizie statystycznej z wykorzystaniem arkuszy kalkulacyjnych PowerStatsV12 oraz PowerStatsV12_THO1_Data (Promega Corp.) oaz GDA v.1.1 pod kątem ich przydatności w badaniach kryminalistycznych i medyczno-sądowych. Następnie wyniki uzyskane dla próby populacyjnej Wielkopolski porównano0 z wynikami dla populacji Polski Zachodniej, Polski Północnej, Małopolski oraz danymi dla populacji polskiej opublikowanymi na stronie internetowej Wydziału Biologii Centralnego Laboratorium Kryminalistycznego KGP, stosując test statystyczny z-test frakcji.

Słowa klucze: Short Tandem Repeats (STRs), AmpFISTR SGM Plus, badania populacyjne, Wielkopolska

Summary

The article presents the results of a research on allelic frequencies of the 10 STR loci in a Greater Poland population sample. The DNA, isolated from 214 samples of blood and buccal swabs using the organic method, was amplified with the help of PCR method using the AmpFIST® SGM Plus reagents, produced by Applied Biosystems. Then, the products of amplification were subject to electrophoresis. Subsequently, the obtained data was statistically analyzed, taking into account their usefulness in forensic examinations. Then, the results obtained in the Greater Poland population sample were compared with the results achieved for the population of Western and Northern Poland, the Lesser Poland as well as the data published on the official site of Biology Department of Central Forensic Laboratory of the Polish Police.

Keywords: Short Tandem Repeats (STRs) AmpFIST® SGM Plus, population-based study, Greater Poland.

Pliki do pobrania