Renata Rodzik, Magdalena Dębska
Streszczenie
Celem pracy było przeprowadzenie walidacji wewnętrznej magnetycznej metody izolacji DNA z zastosowaniem AutoMate ExpressTM Forensic DNA Extraction Systenm i sprawdzenie, czy nowa metoda ekstrakcji może być wdrożona w Zakładzie Biologii CLKP i rutynowo wykorzystywana w badaniach kryminalistycznych obejmujących identyfikację ludzkiego DNA. Charakterystykę badanych parametrów przeprowadzono na podstawie rekomendacji ENFSI DNA Working Group zawartych w Recommended Minimum Criteria of the Valiation of Various Aspects of the DNA Profiling Process (2010). Podczas badań walidacyinych testowano następujące parametry: czułość i liniowość, powtarzalność i odtwarzalność, badanie kontaminacji krzyżowej, badanie różnych typów biologicznych próbek kryminalistycznych analizowanych w laboratorium Zakładu Biologii CLKP oraz porównano efektywność metody magnetycznej z metodami ekstrakcji stosowanymi w Zakładzie Biologii CLKP (metodą organiczną oraz absorpcji-elucji). W wyniku przeprowadzonych badań stwierdzono, że AutoMate ExpressTM Forensic DNA Extraction System spełnia stawiane w założonych kryteriach akceptacji wymagania, umożliwia zautomatyzowaną i szybką ekstrakcję DNA pozwalającą uzyskać wysokiej czystości i jakości ekstrakty DNA. W związku z tym może być wdrożony i rutynowo wykorzystany do badań kryminalistycznych – ekstrakcji DNA ze śladów biologicznych.
Słowa klucze: walidacja, automatyzacja, robotyka, izolacja DNA, kulki magnetyczne
Summary
The aim of this study was to validate the magnetic method of DNA extraction using AutoMate Express TM Forensic DNA Extraction System and demonstrate that the instrument is appropriate and fit for human identification. The characteristics of tested parameters was based recommendations of ENFSI DNA Working Group that are included in the Recommended Minimum Criteria of the Validation of Various Aspects of the DNA Profiling Process (2010). The following parameters were taken into consideration: test sensitivity and linearity, repeatability and reproducibility, cross-contamination, examination of different types of forensic biological samples that are analysed in laboratory CFLP of the Department of Biology and results of comparing the efectiveness of magnetic methods with methods used in the CFLP (organic and absorption- elution). The system meets the relevant requirements in established acceptance criteria, enables automated and rapid extraction of DNA to obtain high purity and quality of DNA extracts. In that respect, it may be inplemented and routinely used for forensic research – DNA extraction from biological traces.
Keywords: validation, automation, robotics, extraction of DNA, paramagnetic beads